扁桃体作为一个免疫器官，具有自身的抗病菌抗病毒功能。特别是针对儿童，扁桃体对身体具有重要的保护作用，如果随意的切除，就会失去局部的免疫反应，甚至出现免疫监视障碍，因此扁桃体切除手术应该咨询专业的医生之后再考虑是否切除。
正常情况下，3-5岁时由于儿童会接触外界较多的病菌，扁桃体会显著增大，称为生理性肥大。青春期后，扁桃体的免疫活动趋于减退，扁桃体组织也会逐渐的缩小，所以不需要治疗。但是如果扁桃体反复，发生炎症感染，或者过度肥大影响吞咽、发音、呼吸功能时，应该手术切除。这时的切除扁桃体对于身体坏处大于好处，因为长期的慢性炎症感染可能会导致全身并发症，如肾炎、皮肤病等。而且过度肥大的扁桃体会引起张口呼吸，导致牙齿及颌面骨的发育异常或者影响身体发育，是一种不可逆的后果。
如果扁桃体发炎的是孩子的话，不建议过度使用内服药，因为孩子的免疫系统不如大人完善，可以先使用纯中药的外用喷剂，如宁药尘扁喷。 它使用的是古草世家品牌，外用喷剂无副作用，一般1到2个疗程就可以见效，外喷药剂主要以乙醇、贝母、铁皮石斛、蒲公英等天然植物提取液为有效成分，对大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、白色念珠菌等有杀灭作用，对皮肤表面抗菌抑菌有很好的效果。
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